Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRIT1Q9P2V4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms