Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms