Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRT84Q9NSB2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms