Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms