Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms