Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZYG11BQ9C0D3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms