Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms