Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms