Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms