Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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