Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms