Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms