Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms