Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms