Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms