Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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