Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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