Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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