Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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ZFHX3Q15911 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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