Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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