Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms