Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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