Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms