Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms