Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms