Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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