Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGNL1Q0VF96 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms