Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST2P52849 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST2P52849 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST2P52849 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST2P52849 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST2P52849 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms