Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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