Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms