Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ADSSP30520 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ADSSP30520 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ADSSP30520 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ADSSP30520 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ADSSP30520 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ADSSP30520 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ADSSP30520 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ADSSP30520 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ADSSP30520 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms