Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms