Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT4P19013 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms