Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAK2O60296 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms