Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms