Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF103O00237 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF103O00237 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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