Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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