Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms