Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP15Q9Y4E8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms