Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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