Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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