Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS9D1Q9Y2B5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms