Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms