Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX3Q9UBR4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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