Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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