Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT82Q9NSB4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms