Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD93Q9NPY3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms