Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms