Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms