Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms